В мире Наруто незаметно пролетели два года. Бывшие новички пополнили ряды опытных шиноби в ранге чуунин и джоунин. Главные герои не сидели на месте – каждый стал учеником одного из легендарных Саннин – трех великих ниндзя Конохи.